Na Přírodovědecké fakultě UK jsem instaloval výpočetní klastr 14 počítačů PC s operačním systémem Linux (procesory Pentium4, 2-3GB RAM, ASUS P4C800E-Deluxe) a jedním dvouprocesorovým serverem (procesory Xeon 3 GHz a 16GB RAM, MSI9136). Klastr je spojen gigabitovou interní sítí, sdílený diskový prostor je přístupný formou AFS v1.4. Na počítačích jsou instalovány mnohé programy nutné pro bioinformatiku, např. blast, clustalw, fasta, phylip, paup, biopython, bioperl, R, bioconductor. Používá Gentoo Linux.

Později jsem konfiguroval klastr skládající se z 32 uzlů na bázi 4-jádrových Intel CoreQuad (2GB RAM) a jednoho serveru (4GB RAM), všechno na bázi základní desky MSI P35Neo2-FIR. Server má softwarový Linux md RAID 1 a 10 přes několik SATA disků a exportuje diskové pole přes NFSv3. Samozřejmě klastr je doplněn záložními zdroji pro případ výpadku napájení, KVM konzolí pro vzdálenou správu a počítače sériovou konzolí RS-232. Na klastru je jako paralelizační prostředí mpich2 a jako dávkový systém torque/openPBS. Používá rovněž Gentoo Linux.